Добрый день. Значит данные при объединении баз Росреестра и БТИ выгрузились некорректно. Ошибку можно исправить через личное обращение в Росреестр. Проблем при покупке/продаже быть не должно.

Если Ваш покупатель согласен с тем, чтобы у него в выписке из ЕГРН осталась такая ошибка, то вы можете провести сделку. Но исправить ошибку можете и Вы, как продавец, это несложно. Обратитесь с соответствующим заявлением в Росреестр.

"В договоре купле-продажи квартиры и свидетельстве о праве собственности от 2004 года, когда в общую площадь квартиры еще входила площадь балкона, указано 63 кв.м. Сейчас, в выписке ЕГРН и на всех сервисах проверки недвижимости, общая площадь этой квартиры указана такая же, 63 кв.м. " - а в чем проблема-то? )) ;
"и не будет ли проблем при покупке/продаже этой квартиры?" - ну, если вы покупателю специально тыкнете пальцем в это несоответствие и расскажете что "раньше было вот так, а сейчас должно быть вот так, но почему-то не так" - тогда, наверное, проблемы возникнут ))

Если продавать в текущем виде, то всё зависит от внимательности ваших покупателей и их представителей, в том числе банковских юристов: у меня на прошлой неделе звонил клиент, консультировался с аналогичной ситуацией, где у него правоустанавливающи документы были от 2013 года и в Егрн указана общая площадь с учетом балкона. У клиента был покупатель с ипотекой и накануне сделки, юристы банка сказали исправлять документы, чтобы площадь в егрн была без балконам и отказали в проведении сделки.
Поэтому, вам надо исправлять ошибку в Егрн или вносить изменения на основании технических документов, чтобы была указана общая площадь, туз усато лоджий и балконов.